[VIP第1年] 指数:3
第三代测序技术以PacBio公司的SMRT技术和OxfordNanoporeTechnologies公司的纳米孔单分子技术为**的新一代测序技术被称为第三代测序技术，与前两代测序技术相比，其比较大的特点就是单分子测序，测序过程无需进行PCR扩增，湖北定制迈杰转化医学NGS平台郑重承诺，并且理论上可以测定无限长度的核酸序列。PacBio技术平台SMRT芯片是一种带有很多ZMW孔的厚度为100nm的金属片，将DNA聚合酶、待测序列和不同荧光标记的dNTP放入ZMW孔的底部。荧光标记的位置是磷酸基团，当一个dNTP被添加到合成链上的同时，它会进入ZMW孔的荧光信号检测区，根据荧光的种类就可以判定dNTP的种类，从而获得核酸的碱基序列信息，湖北定制迈杰转化医学NGS平台郑重承诺，湖北定制迈杰转化医学NGS平台郑重承诺。ZMW孔PacBio平台测序原理每个ZWM孔只允许一条DNA模板进入，DNA模板进入后，DNA聚合酶与模板结合，加入4种不同颜色荧光标记4种dNTP，其通过布朗运动随机进入检测区域并与聚合酶结合从而延伸模板，与模板匹配的碱基生成化学键的时间远远长于其他碱基停留的时间，因此统计荧光信号存在时间的长短，可区分匹配的碱基与游离碱基。通过统计4种荧光信号与时间的关系，即可测定DNA模板序列。 【迈杰转化医学】一直以来致力于转化医学服务和伴随诊断产品开发及商业化。湖北定制迈杰转化医学NGS平台郑重承诺
3、主要平台提供方ABI公司三、二代测序简介1、Roche454测序:454测序是大规模平行测序的开始。2003年底，454公司推出了基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统—(GS)。2005年454公司被罗氏诊断公司收购，之后优化推出GenomeSequencerFLXSystem(GSFLX)。罗森博格博士是该技术的创始人,也是IonTorrent平台的创始人。454平台的突出优势是长读长(400nt)，但准确率低，成本高。是高通量测序的过渡。454测序技术的具体步骤为：（1）构建测序文库。将基因组DNA打碎成300～800个碱基片段后，在两端加上锚定接头；（2）PCR扩增。扩增产生成千上万个拷贝；（3）焦磷酸测序。复制过程中如果发生碱基互补配对，就会释放1个焦磷酸，在一系列酶的催化下，释放出荧光信号，会被CCD捕获到。每个碱基反应都会捕获到1个荧光信号，由此一一对应，模板的碱基序列由此获得。作者：心平气和链接：源：知乎著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。 辽宁多组学迈杰转化医学NGS平台推荐咨询迈杰转化医学利用新一代智能技术补充传统医学的检测模式，赋能医疗健康建设，更好地为临床和患者服务。
GC-MS（气相色谱/质谱联用仪）GC-MS简介GC-MS是气相色谱-质谱联用技术的简称，是将气相色谱仪与质谱仪通过适当接口相结合，借助计算机技术，进行联用的分析技术。GC为气相色谱，流动相为惰性气体，多为氦气，由进样口、色谱柱和检测器三部分构成；MS为质谱，由离子源、滤质器、检测器三部分构成，广泛应用于纯物质鉴定。GC-MS因其具有GC的高分辨率和MS的高灵敏度，被广泛应用于复杂组分的分离与鉴定，是生物样品中药物代谢中定性与定量的主要工具。应用领域代谢组学分析药物分析结构鉴定生物组织蛋白分析物质组分鉴定检测示例技术流程送样须知血清、血浆≥尿液≥动物组织≥250mg样本寄送地址：天津经济技术开发区第十三大街37号逸夫楼225，降老师（收）（具体样本保存与运输条件请与我们联系）我们的优势1、提供各种实验材料和仪器，满足项目课题实验需要。2、专业的操作人员。3、高规格实验室。4、数据结果交付周期快。5、完善的服务体系，全程跟进，确保满意。咨询与订购感谢您选择我们的服务，如果您有任何问题，请联系我们，我们将竭诚为您解答和服务。客服电话：网站：邮箱：market@QQ：一、测序策略：提取样品的基因组DNA，检测基因组DNA的完整性和浓度。
1977年，WalterGilbert和FrederickSanger发明了***台测序仪，并应用其测定了***个基因组序列，噬菌体X174，全长5375个碱基。由此开始，人类获得了探索生命遗传本质的能力，生命科学的研究进入了基因组学的时代，到至今为止的四十年时间内，测序技术已取得了相当大的发展，从***代发展到了第三代测序技术。Sanger所发明的测序方法被称为***代测序技术，该技术直到现在依然被***使用，但是其一次只能获得一条长度在700～1000个碱基的序列，无法满足现代科学发展对生物基因序列获取的迫切需求。高通量测序(High-ThroughputSequencing,HTS)是对传统Sanger测序的**性变革，其解决了一代测序一次只能测定一条序列的限制，一次运行即可同时得到几十万到几百万条核酸分子的序列，因此也被称为新一代测序(NextGenerationSequencing,NGS)或第二代测序。第二代测序技术虽然测序的通量**增加，但是其获得单条序列长度很短，想要得到准确的基因序列信息依赖于较高的测序覆盖度和准确的序列拼接技术，因此**终得到的结果中会存在一定的错误信息。因此，科研人员又发明了第三代测序技术也称为单分子测序技术，该技术在保证测序通量的基础上，对单条长序列进行从头测序。 迈杰转化医学为全球合作伙伴提供包括生物标记物挖掘、药物靶点验证、伴随诊断开发等一体化解决方案。
PacBio技术的优缺点PacBio技术的优点：无需PCR扩增，不会人为的引入突变；超长读长，平均读长可达到10Kb，**长读长可以达到40Kb；覆盖均匀，无GC偏好性；通过reads的自我矫正，10X以上准确率能够达到；可以直接检测到甲基化信息，同步进行表观遗传学识别。PacBio技术的缺点：单条序列错误率较高，平均核苷酸准确性不到85%；测序成本较贵。PacBio技术的应用基因组组装利用PacBio测序平台，可以克服部分序列GC含量高或重复序列多等问题，更好的进行基因组详细描绘，从而进行精细的基因注释等研究。PacBio测序平台不需要进行PCR扩增，因此可以减少基因组组装过程中的人为错误和偏差。PacBio测序平台读长较长，因此相比二代测序拼接结果更为准确，同时可以利用其长片段来填补二代数据组装中产生的gap和连接contig为scaffold。全长转录组测序利用PacBio测序平台读长较长的特点，进行转录组测序可以直接得到转录本的全长序列，省去了二代测序的拼接过程，使得过程更为简便，结果更为准确。 迈杰转化医学病理检测平台配备有Roche/Leica/Dako等多种全自动检测仪器，有病理医生进行精确的判读。湖北定制迈杰转化医学NGS平台郑重承诺
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，构建单链DNA测序文库。，固体支撑体的每一个单独小空间中只包含一条DNA链，之后通过PCR特异性的将模板DNA进行富集，从而达到测序所需的模板量。，反应试剂清洗和成像捕捉，不断反复进行此三步循环，每一个循环按顺序测定序列中的一个碱基。第二代测序技术的优缺点第二代测序技术的优点：一次能够同时得到大量的序列数据，相比于一代测序技术，通量提高了成千上万倍；单条序列成本非常低廉。第二代测序技术的缺点：序列读长较短，Illumina平台**长为250-300bp，454平台也只有500bp左右；由于建库中利用了PCR富集序列，因此有一些含量较少的序列可能无法被大量扩增，造成一些信息的丢失，且PCR过程中有一定概率会引入错配碱基；想要得到准确和长度较长的拼接结果，需要测序的覆盖率较高，导致结果错误较多和成本增加。第二代测序技术的应用二代测序是现阶段科研市场的主力平台，主要应用包括：基因组测序、转录组测序、群体测序、扩增子测序、宏基因组测序、重测序等。由于成本较低，二代测序在医学领域应用也十分***，主要包括：**基因组、遗传病基因组、**与代谢疾病等。 湖北定制迈杰转化医学NGS平台郑重承诺
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